Для рейда лучше винчестеры брать максимально одинаковые.
Да в случае рейда 0 все файлы разделяются на части и 1 часть хранится на 1 винте а другая на 2 => летит 1 винт => летит весь рейд и вся инфа

Ну и износ винтов выше чем без рейда... винты то работают оба всегда так как фрагментированы и фрагменты на разных винтах (поэтому и скорость в 2 раза выше).
На мат платах реализован програмный рейд - тоесть часть ресурсов будет задействована для его нужд... Аппаратный рейд естественно лучше, но для домашнего пользователя покупать отдельную плату думаю не стоит.
НА счет глюков с разными модулями: теоретически глюков не должно быть если модули разные даже по частоте ( будут использовать наименьшую общую частоту и соответсвующие тайминги) но на практике возможно всякое