действительно проверь его на другом компе (но практика показывает, что тоже самое будет)
карточный читатель стоит в среднем 300р
так что не мучай голову и купи новый
в этом наверняка погорел микросхема порта (аль просто кратковремённо затыкается) и начал читатель глючить
второй маловероятный вариант: виноваты окошки и они занимаются потерей связи с читателем