Как известно, виндовс задумывался не как серверная ось. Есть конечно windows 2003, его они похоже и используют. Но виндовс не подходит для вебсервера, скорее он будет лучше для днс или файлового сервера. Во всяком случае он не подходит для вебсервера, использующего интерполятор PHP, на нём лучше всего делать то, что родное для виндовс - IIS + ASP. IIS + PHP имеет множество недостатков - невозможно запустить php как fastcgi, множество мифических глюков и так далее.
Apache + PHP на виндовс несколько лучше, но для апаче построение нитей на виндовс выглядит, во всяком случае для меня, несколько более сложным, чем на *nix подобных осях. В итоге производительность низко снижается, да ещё и учитывая низкую производительность самого апача.
Вообще, могу сказать по секрету, что администрировать виндовс сервер намного сложнее, чем сервер на *nix. Хотя кому как. Во всяком случае сейчас мы видим достойное тому подтверждение - чрезвычано низкая производительность вебсервера у nntt уже при 200 пользователях онлайн, в то время как наш сервер держал вчера 400 пользователей онлайн без особых проблем (мы не используем апач)