Сложности возникают у тех кто предполагает, что самая первая клетка д.б.быть такой же структуры как и сейчас ... а если представить что это не так - то дарвинизм вполне в состоянии все это объяснить.
Клетка могла по-другому питаться, использовать совсем другие в-ва в качестве энергии, носителем наследственной информации могла быть не ДНК а что-то другое (либо некий примитивный прототип ДНК) .... а все те сложности и навороты которые мы видим сейчас - вполне могли появиться в результате миллиардов лет эволюции
Ну вот примерно как тут :
[Для просмотра данной ссылки нужно зарегистрироваться]
Кстати, лет 20-30 назад такие органы как глаз и ухо тоже считались "несократимыми биологическими системами", а недавно вполне убедительно было доказано что они могут эволюционировать. Даже фильм тут выкладывали, под названием "Был ли Дарвин прав?"