FantoMass,
Цвет можно оставить по умолчанию черный но при рендере обязательно выбрать RGB+Alpha
и лучше если формат QuickTime Movie,
тогда в Премьере проблем вообще не будет.
А чтобы проверить есть ли в проекте альфаканал, нажми "шашечки" и черный фон должен пропасть, если не пропал
то значит что альфаканал отсутствует.